Les mandarines presenten una sensibilitat molt elevada a les baixes temperatures desenvolupant taques en la pell i reduint la seva qualitat comercial. Per això cada varietat posseeix unes característiques de refredament pròpies i s'aplicaran temperatures de l'ordre de 5ºC i 90% d'humitat relativa en el cas genèric de no conèixer les condicions de conservació adequades.

La principal causa de deterioració fisiològica en els cítrics és l'estrès d'aigua que es produeix en separar el fruit de l'arbre. En el cas de les mandarines s'agreuja més perquè presenten una superfície molt alta en relació amb el volum i una escorça més fina que facilita la deshidratació. La transpiració que es produeix en el fruit causa en l'escorça dessecació, arrugamiento, estovament i accelera l'envelliment del fruit. Al mateix temps que el fruit s'estova, es redueix l'acidesa, el contingut en vitamina C i les característiques organolépticas de sabor i comestibilidad.

L'aplicació de baixes temperatures a les mandarines emmagatzemades serveix per allargar la vida útil, per reduir la transpiració i evitar la proliferació de fongs. Es podria pensar que com més baixa fos la temperatura, més temps durarien els fruits sense pèrdua de qualitat. No obstant això hi ha dues limitacions a l'hora d'aplicar baixes temperatures. La primera és que no es pot sobrepassar la temperatura de congelació de les mandarines que ronda entorn dels 0-1,5ºC. La segona és que les mandarines són molt sensibles a les baixes temperatures desenvolupant taques en la pell i diferents alteracions que fan perdre qualitat comercial.

A cada tipus de varietat se li sol aplicar unes condicions de refredament que consisteixen en temperatures tant més altes quant el fruit presenta major sensibilitat als danys per fred. D'altra banda la humitat relativa ha de ser propera al 90%. Així, les condicions òptimes d'emmagatzematge per a algunes varietats són les següents:


CONREAR::TEMPERATURA (ºC)::Temps aproximat de conservació (setmanes)
Clementina::4 – 5::6 - 10
Ellendale::5 – 6::8 - 10
Fortune::9 – 10::4 - 6
Nova::9 – 10::2 - 4
Ortanique::5 – 6::10 - 12
Satsuma::1 – 2::4 - 6
Font: II Congrés de Citricultura de la Plana (23,24,25 de març de 1995)

Quan no es coneixen les característiques d'una varietat, s'apliquen unes condicions generals de magatzematge de 5ºC i 90% d'humitat relativa.

Durant el transport les mandarines deuen estar protegides contra els agents atmosfèrics. En el cas que el transport es realitzi per carretera, els camions han de mantenir la caixa del camió a la temperatura i humitat adequades a la fruita que transporten, prestant especial interès a mantenir una correcta circulació del corrent de refrigerant.

ja que tots els cítrics, incloent la mandarina, són peribles s'han de mantenir unes condicions adequades durant el transport perquè els fruits arribin al punt de consum en perfectes condicions. Les mandarines deuen protegir-se de la pluja, insolació , vent, etc.

Els camions de transport mantindran la temperatura de la caixa al voltant dels 0ºC i una humitat relativa entorn del 85-95%. La càrrega mai ha de recolzar-se en les parets, ni sostre i ha d'existir un espai adequat entre els envasos per a una correcta circulació del corrent refrigerant. Si s'utilitzen envasos de diferents grandàries o la càrrega no és completa, els buits hauran de ser ocupats per envasos buits.

Els camions disposaran de registres de temperatura i humitat per verificar que les condicions de transport han estat les adequades.

Segons la distància, les condicions del fruit, la situació del mercat, etc., es triarà el mitjà de transport més adequat. Als països de la Unió Europea es fa per carretera, als països de l'est d'Europa per ferrocarril i a països com Japó, Estats Units o Canadà es realitza a través de vaixell.

El transport per carretera és el més utilitzat per la seva rapidesa, comoditat de descàrrega i cost més reduït.

Les mandarines són molt sensibles al fred i en nombroses ocasions apareixen taques fosques en la pell. A més poden aparèixer com en la majoria de cítrics les podridures provocades per diferents fongs.

Les mandarines són molt sensibles a les baixes temperatures i propenses a les lesions per fred. Aquestes poden ser el ‘picat’ o ‘pitting’ que és la més comuna i que es caracteritza per depressions en la pell de forma circular amb una certa decoloración que amb el temps s'enfosqueixen. Si el fruit està sobremadurado poden aparèixer taques fosques en la pell de forma irregular que es van estenent per la superfície del fruit. Aquesta alteració també és a causa del fred i es diu escaldat.

Si el fruit és sotmès a una elevada humitat durant l'emmagatzematge apareix l'anomenat ‘oil-darkening’ o ennegriment de les glàndules oleíferas que contenen els olis essencials i que en estendre's per l'escorça pot confondre's amb l'escaldat.

Un altre tipus d'alteració per fred menys comú és l'anomenat ‘watery break-down’ la qual es caracteritza per un aspecte esponjoso i tou en els fruits com si haguessin estat congelats.

Tots aquests danys per fred apareixen amb més freqüència com més gran és el temps de permanència en les càmeres i més baixa és la temperatura de magatzematge. Els símptomes poden ser visibles en les càmeres i es manifesten totalment quan els fruits passen a temperatures ambientis.

Un altre tipus d'alteracions que poden sofrir les mandarines són els fongs que provoquen podridures en tots els cítrics. Així podem trobar:
- Podridura verda provocada per Penicillium digitatum caracteritzada per un espores verdes.
- Podridura blava, causada per Penicillium italicum caracteritzada per un espores de color blau algodonoso.